數(shù)據(jù)庫名稱 | 化學結構數(shù)量 | 網站 |
PubChem | 9300萬結構以上 | https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/ |
European Biometrics Institute UniChem | 1.51億結構以上 | https://www.ebi.ac.uk/unichem/ucquery/stats |
Royal Society of Chemistry – ChemSpider | 1.14億結構以上 | https://www.chemspider.com/ |
National Cancer Institute – Chemical Structure Lookup Service(NCI) | 7400萬結構以上 | https://cactus.nci.nih.gov/cgi-bin/lookup/search |
ChemNavigator iResearch Library | 3.71億結構以上 | https://www.chemnavigator.com/cnc/products/irl.asp |
Elsevier – Reaxys | 2900萬結構以上 | https://www.elsevier.com/solutions/reaxys |
ACS/CAS – Chemical Abstracts Service | 1.5億結構以上 | https://www.cas.org/ |
PubChem 檢索可得到的結果包含了分子式、SMILES、2D和3D結構、InChI和InChIKey、相對分子質量、脂水分配系數(shù)、氫鍵受體和供體數(shù)目、可旋轉鍵數(shù)目、互變異構體數(shù)目等基本的結構信息和物化性質,除此以外,還有該化合物作為藥物的劑型和商品信息、藥理性質、毒性、生物活性檢測等信息,并通過文獻分類副標題可以查看相關文獻NIST Chemistry WebBook https://webbook.nist.gov/chemistry/name-ser/
美國國家標準與技術研究院(National Institute of Standards and Technology,NIST)直屬美國商務部,從事物理、生物和工程方面的基礎和應用研究,以及測量技術和測試方法方面的研究,提供標準、標準參考數(shù)據(jù)及有關服務,在國際上享有很高的聲譽。NIST的科學家主要從事生物技術、化學、半導體電子學、陶瓷學、物理學、光電子學、防火、聚合物、信息技術、制造工程和計量科學。ChemSpider http://www.chemspider.com/
ChemSpider是一個隸屬于英國皇家化學會的匯總數(shù)據(jù)庫,包含了來自不同資源提供的五千五百多個化合物信息?,F(xiàn)在,該數(shù)據(jù)庫含有的信息包括海洋天然產物數(shù)據(jù)、ACD實驗室化學數(shù)據(jù)庫、EPA的DSSTox數(shù)據(jù)庫以及來自不同供應商的一系列化學物質信息。數(shù)據(jù)庫擁有多種搜索工具,而且大多數(shù)化合物都有計算物理化學性質值。Phenol-Explorer http://phenol-explorer.eu/
Phenol-Explorer是第一個專門為食品中多酚含量創(chuàng)建的綜合數(shù)據(jù)庫。數(shù)據(jù)庫中含有400種食物中500個不同多酚類物質的35,000多個含量值。這些數(shù)據(jù)信息是從1,300多篇科學文獻當中提及的60,000多種原始含量值中提取而來。ZINC https://zinc.docking.org/
包含2000多萬個化合物分子,適用于虛擬篩選。用戶可以自行繪制或輸入分子的SMILES字符串來上傳待檢索的分子,同時,還可以限定凈電荷量、xLogP、可旋轉鍵數(shù)、氫鍵供體和受體數(shù)等參數(shù)范圍。庫中的分子結構均可被免費下載,支持SMILES、mol2、3DSDF和DOCK flexibase格式,并且化合物的相關信息可以以表格形式下載,便于用戶使用。DrugBank https://go.drugbank.com/
藥物信息包括了該藥物的CAS號、商品名、分子式、分子量、SMILES、2D和3D結構、logP、logS、pKa、熔點、吸收性、Caco-2細胞穿透性、藥物類別和臨床使用、性質描述、劑型與給藥途徑、半衰期、體內的生物轉化、毒性、作用于哪些生物體、食物對服用的影響、與其它藥物的相互作用、作用機理、代謝途徑、藥理學特征、與蛋白質的結合情況、溶解度、物質形態(tài)、同義詞、關于合成的相關文獻等,還與ChEBI、GenBank、PubChem等外部數(shù)據(jù)庫有鏈接。Toxnet http://toxnet.nlm.nih.gov/
Toxnet是美國國家醫(yī)學圖書館(nlm)的化合物毒性相關數(shù)據(jù)庫,包括藥品毒理學、危險化學品和其它相關領域的信息,從Toxnet可對下列子數(shù)據(jù)庫進行檢索:HSDB (危險化合物數(shù)據(jù)庫):內含4500種毒性(或可能具有毒性的)化學藥品,以及其毒性、對環(huán)境的影響、化學安全性、廢棄物處置等相關領域的信息。TOXLINE 包括藥物和其它化學物質的生物化學、藥理學、生理學、毒理學的文獻數(shù)據(jù)庫。其中有300萬條引文、幾乎都有摘要和/或檢索條、以及CAS登錄號。2、國內的化學數(shù)據(jù)庫
RTECS主要包括以下六大類化學物質的毒性數(shù)據(jù):直接刺激性(Primary irritation);致突變性(Mutagenic effects);對生殖的影響(Reproductive effects,即致畸性);致腫瘤性(Tumorigenic effects);急性毒性(Acute toxicity);其他多劑量毒性。其中記錄有該化學物質的數(shù)值毒性值,如半數(shù)致死量(LD50或LC50),最低中毒劑量(TDLo),最低中毒濃度(TCLo)等,以及實驗所使用的物種和給藥途徑。最好通過不同方式如CAS號,通用名多次查詢,因為有些化合物可能通用名查不到,CAS號卻能查到。ChemBlink https://www.chemblink.com/indexC.htm#opennewwindow/
首頁檢索(該數(shù)據(jù)庫檢索與Drug future-化學物質毒性數(shù)據(jù)庫類似,需通過CAS號和化學名等多次檢索,有時候CAS號搜不出來,化學名可以,如下面CAS號搜索沒有結果,但是用化學名Tetrabutylammonium bromide就可以得到結果):提供化合物的安全技術說明書(MSDS),說明書中毒性一欄(Toxicological Information)會提供化合物的一些毒性數(shù)據(jù)。Chemical Book www.chemicalbook.com/
ChemicalBook是一家致力于為化學行業(yè)用戶提供最有價值信息的資源平臺,平臺可以使用使用中文名稱,CAS號,英文名稱,分子式,分子量,MDL號,EINECS號,結構式等多種方式檢索,提供供化合物的安全技術說明書(MSDS),說明書中毒性一欄(Toxicological Information)會提供化合物的一些毒性數(shù)據(jù)。物競數(shù)據(jù)庫 http://www.basechem.org/
物競數(shù)據(jù)庫是一個全面、專業(yè)、專注,并且免費的中文化學品信息庫,為學生、學者、化學品研究機構、檢測機構、化學品工作者提供專業(yè)的化學品平臺進行交流。數(shù)據(jù)庫采用全中文化服務,完全突破了中英文在化學物質命名、化學品俗名、學名等方面的差異,所提供的數(shù)據(jù)全部中文化,更方便國內從事化學、化工、材料、生物、環(huán)境等化學相關行業(yè)的工作人員查詢使用。蓋得化工網 https://china.guidechem.com/
蓋德化工網,誕生于2009年,提供基于互聯(lián)網平臺的專業(yè)性貿易撮合與促進服務,為化學品采購商和供應商提供服務,平臺在以真實、精準、豐富為目標,建立了化工產品庫、公司數(shù)據(jù)庫,提供自動撮合匹配的采購通服務,可大大提高采購商找產品效率。為助力化工企業(yè)研發(fā)、安全管理,建立了蓋德化工字典數(shù)據(jù)庫,目前已收錄了7000多萬條化合物數(shù)據(jù),包括結構式、物化屬性、用途、安全數(shù)據(jù)、核磁圖譜、合成路線等。化源網 https://www.chemsrc.com/casindex/
化源網提供全方面的化合物搜索,包括常規(guī)搜索,官能團和結構式搜索,是國內僅有的一兩個能提供全面搜索服務的網站之一。擁有自主產權的化合物搜索引擎。特點是速度快、結果準確、輸入智能模糊容錯?;淳W的搜索即搜即得,最佳匹配您的需求。化合物數(shù)據(jù)庫豐富。目前收錄了500多萬條唯一CAS編碼的產品信息,產品信息全面涵蓋產品的合成路線,文獻索引,理化性質,上下游產品,MSDS,供應商信息。另外億級化合物數(shù)據(jù)庫產品陸續(xù)添加中。化學加 http://data.huaxuejia.cn/
化學加搜索——全球三大化合物數(shù)據(jù)庫之一,2018年11月獲得國家級“大數(shù)據(jù)科技傳播獎.優(yōu)秀團體創(chuàng)新獎”。與化學加APP、微信小程序同步。超過4000萬條CAS號,數(shù)據(jù)精準,且已關聯(lián)上該產品的所有已入駐化學加網的供應商。CAS號:又稱CAS NO.、 CAS Registry Number、CAS Number 、CAS登錄號 。龐大的化合物名數(shù)據(jù)庫,超過1.2億條化合物數(shù)據(jù),覆蓋中文與英文。且已關聯(lián)上該產品的所有已入駐化學加網的供應商。智能的化學式輸入識別,最靈活的輸入方式,精準的搜索結果。
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